È l’ispiratore e fondatore del Gruppo Abele, che sviluppa proposte per affrontare il disagio sociale, a partire dal sostegno ai tossicodipendenti, e dell'Associazione Libera contro i soprusi delle mafie in tutta Italia. Nel 1973 il Gruppo Abele ha inaugurato il “Centro Droga”, un luogo di accoglienza e ascolto per i giovani con problemi di tossicodipendenza, esperienza allora unica in Italia, cui è seguita l’apertura di diverse comunità. Negli anni novanta l’impegno di don Ciotti si è allargato al contrasto alla criminalità organizzata, in particolare dopo le stragi di Capaci e via d’Amelio dell’estate del 1992. Tra le sue pubblicazioni, si ricordano Dialogo sulla legalità, scritto con Nichi Vendola (Manni, San Cesario di Lecce 2005) e La speranza non è in vendita (Giunti, Milano 2012).